一、基本治療
　　1．執行眼部接觸隔離。
　　2．分泌物多者，用生理鹽水、硼酸水或抗生素溶液沖洗結膜囊每日數次，并滴或涂磺胺類、抗生素溶液或眼膏，4～6/d。也可用1%硝酸銀涂布瞼結膜，隨即用生理鹽水沖洗，1/d。
　　3．炎癥嚴重或分泌物多，局部治療療效不佳者，可全身用磺胺藥或抗生素。
　　4．對流行性出血性結膜炎可用生理鹽水沖洗，3/d，1%～5%鹽酸嗎啉胍溶液及類固醇液滴眼等治療。如伴有全身癥狀， 可請傳染科會診。醫護人員接觸患者后，應用0.1%過氧乙酸溶液洗手，防止交叉感染。
　　5．慢性結膜炎注意病因治療，如為普通型慢性結膜炎，可使用復方硫酸新霉素滴眼液進行治療一次2-3滴 , 一日4-8 次或遵醫囑，使用前請注意說明書。紅霉素眼藥水也可以有效的治療角膜炎結膜炎等，需配合紅霉素眼藥膏使用（晚睡前使用）使用前請注意說明書。如有慢性淚囊炎者應先治療， 找不到原因者可加用0.5%硫酸鋅等滴眼。

　　二、物理治療
　　結膜炎的治療，若是急性病毒性結膜炎，可點用類固醇（可地松）眼藥水，以減輕病情。細菌性結膜炎，則須投與抗生素藥水、藥膏，甚至口服或注射抗生素。治療慢性結膜炎，必須先找出原因。若是環境刺激原引起的，則盡量減少接觸刺激源，如減少到公共場所（尤其是密閉室內）、減少接觸吸煙及燃燒廢棄物之煙灰。若是過敏原引起的，則避免接觸花粉、油漆、灰塵。

　　若長期使用眼藥水或眼藥膏所引起的，可先停用眼藥一段時間，點用不含藥物及防腐劑之眼藥水（如生理食鹽水或人工淚液）；而以毛巾熱敷眼部（閉眼睛）一天三至四次，每次五至十分鐘，也是簡單易行而有效之方法。

　　百濟藥師溫馨提醒：結膜炎雖不是什么大毛病，但結膜炎并不是“眼部充血”的唯一原因。眼部充血除了結膜炎外，也要考慮是眼部其它疾病，如角膜破皮、虹彩炎、青光眼、角膜潰瘍或是眼睛內部發炎等眼疾之警訊，不可以大意。